15 октября 2015 года исполнилось 80 лет со дня образования Института.
Начало пути
10 августа 1935 года народным комиссаром внутренних дел Союза Советских Социалистических Республик подписан приказ «Об организации и комплектовании первого набора десяти межкраевых школ по подготовке оперативного состава Главного управления государственной безопасности (ГУГБ)». Этим приказом предписывалось сформировать специальные учебные заведения по подготовке оперативного состава для планового пополнения органов Главного управления государственной безопасности Народного комиссариата внутренних дел (НКВД) СССР.
15 октября 1935 года состоялось официальное открытие Новосибирской межкраевой школы ГУГБ НКВД СССР.
В 1940 году сдано в эксплуатацию здание школы на Красном проспекте, в котором учебное заведение находится и сейчас.
Институт в годы Великой Отечественной войны
В начале июля 1941 года при Новосибирской межкраевой школе были созданы краткосрочные курсы подготовки оперативного состава, реорганизованные в ноябре 1943 года в Школу Главного управления контрразведки «Смерть шпионам» Народного комиссариата обороны (ГУКР «СМЕРШ» НКО) СССР.
Многие из прошедших обучение в Новосибирске офицеров до победы находились на фронтах войны. Участвуя в боях, они не только решали контрразведывательные задачи, но и ходили в атаки, заменяли в бою выбывших командиров. Более половины из них отдали свои жизни на полях сражений.
Символ воинской чести, доблести и славы – Красное знамя вручено Новосибирской школе 29 апреля 1945 года на основании постановления Президиума Верховного Совета СССР от 27 октября 1944 года. Сейчас это Знамя хранится в Центральном музее Вооруженных Cил Российской Федерации. Школа продолжала свою работу до 31 марта 1948 года.
На защите Родины в мирное время
В 1949 году начался новый этап в развитии учебного заведения.
Частыми гостями в школе были известные ученые, в том числе председатель Сибирского отделения Академии наук СССР академик М.А. Лаврентьев, академик А.Г. Аганбегян, доктор технических наук, профессор Г.С. Мигиренко.
Средняя специальная школа № 311 в 1974 году приказом председателя Комитета государственной безопасности при Совете министров СССР преобразована в Высшие курсы военной контрразведки КГБ при Совете министров СССР.
Большой интерес у слушателей вызывали встречи с прославленными советскими разведчиками и контрразведчиками полковником Р.И. Абелем, К.Т. Молодым (Бен), Д.Г. Федичкиным, В.И. Пудиным, бывшим начальником контрразведки соединения Ковпака Н.И. Стрельцовым, бывшим начальником Управления контрразведки «Смерш» фронта генерал-лейтенантом Н.И. Железняковым.
В 1985 году Указом Президиума Верховного Совета СССР в связи с 50‑летием Высшие курсы военной контрразведки за заслуги в подготовке высококвалифицированных кадров для органов безопасности страны награждены орденом Красной Звезды с вручением Боевого Знамени части как символа воинской чести, доблести и славы.
Важным событием этого периода стало участие слушателей высших курсов в обеспечении безопасности XXII летней Олимпиады в Москве (1980) и Всемирного фестиваля молодежи и студентов в Москве (1985).
Институт в период реформирования
органов государственной безопасности
Важным событием в жизни образовательного учреждения стало его преобразование в феврале 1995 года в Институт переподготовки и повышения квалификации сотрудников Федеральной службы контрразведки Российской Федерации (с апреля 1995 года – Федеральной службы безопасности Российской Федерации).
В 2000 году Институт получил свидетельство о государственной аккредитации, дающее право реализовывать образовательные программы высшего и дополнительного профессионального образования.
С октября 2007 года Институт переподготовки и повышения квалификации сотрудников ФСБ России стал называться Институтом ФСБ России (г. Новосибирск).